舞台は西暦2087年月に誕生した軍事政権による統一国家・ギガノス帝国が地球連合に対して一方的に独立を宣言し宣戦を布告戦火はスペースコロニーと地球本土に拡大し月面のマスドライバーやメタルアーマーMAなどの兵器によって地上の7割はギガノスに占拠されていた そんな中スペースコロニー「アルカード」の住人である主人公・ケーン・ワカバタップ・オセアノライト・ニューマンの3人はひょんなことから新開発メタルアーマー・D兵器ドラグナーのパイロットとして登録されてしまい追撃部隊を撃破するこうして彼らはギガノス帝国の追撃艦隊と戦いながら地球連合軍本部を目指すことになる
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